Особенно интересны в этом отношении:
Ø Нистатин и амфотерицин В – структурные формулы этих сходных полиенов приведены на рис.5. Диаметр поры составляет около 8Ǻ. От 8 до 10 молекул полиена образуют цилиндрическую структуру, в которой гидроксилированные сегменты каждой молекулы обращены внутрь, образуя заполненную водой пору. TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
Рис.5.Структурные формулы нистатина и амфотерицина В и канал, образуемый в мембране этими полиеновыми антибиотиками.
Эта порообразующая молекула является амфифильной, поскольку обладает полярными и наполярными участками. Полярная часть образована гидроксильными и карбонильными группами. Порообразующий комплекс, по-видимому, стабилен внутри слоя.
Ø Грамицидин А-канал образован двумя молекулами грамицидина А, расположенными голова к голове в β (L,D)-спиральной конфигурации (рис.6.). В результате чередования образуется спираль, в которой все боковые цепи располагаются снаружи, а карбонильные группы остова - внутри канала
Рис.6. Схематическое представление канала, образуемого димером грамицидина А в бислое.
Свойства:
а) гидрофобен, нет ни одной полярной аминокислоты;
б) высокая проводимость;
в) канал является катионселективным;
г) проницаемость для одновалентных катионов изменяется: Cs+>Rb+>K+>Na+>Li+;
д) молекулы могут проходить через канал только поодиночке, поскольку его диаметр составляет всего 4Ǻ;
е) вода проходит через канал со скоростью около 108молекул в 1 с при низкой ионной силе;
ж) при достаточно высокой концентрации в мембране (>5мол.%), агрегирует с образованием тубулярных структур.
Ø Аламетицин - представитель природных пептидов, который образует потенциалзависимые каналы. Молекула состоит из 20 аминокислот. Каждый канал образован 6-11 молекулами. Длина составляет 32 Ǻ. Каждый канал образован олигомерным кластером молекул, соединенных водородными связями с образованием стабильной структуры (рис.7.). Представляет хорошую модель, позволяющую объяснить процесс образования поры при ассоциации α-спиралей.
Рис.8. Структура аламетицина
Статьи и публикации:
Зарождение эмпирического научного знания
Эмпирические знания получают в результате применения эмпирических методов познания – наблюдения, измерения, эксперимента. Наряду с фантастическими представлениями о природе человек обогащался реальными знаниями о небесных светилах, растен ...
Суть и свойства стохастического резонанса
Что произойдет, если к внешнему шуму добавить и слабенький, подпороговый периодический сигнал? Заметьте, подпороговый, т.е. который сам по себе, без шума, не смог бы вызвать переход системы из одного состояния в другое!
В этом случае час ...
РOLY-полимераза
Подобно терминальной дезоксинуклеотидил-трансферазе, po1y-полимераза присоединяет нуклеотидные остатки к 3'-концу цепи без участия матрицы. Однако po1y-полимераза проявляет специфичность в отношении РНК. Праймером является полирибонуклеот ...